После распада СССР Союз журналистов, как и многие другие творческие союзы, пережил не самые лучшие времена. Иногда даже вставал вопрос – а нужен ли он, этот союз? Ситуацию не улучшали и непростые взаимоотношения между самими журналистами, внезапно попавшими из социалистического рая в сложный мир капиталистических отношений, жесткой конкуренции и рекламы.

В результате к сегодняшнему дню в Иркутске оказалось два Союза журналистов – областной, под руководством Александра Гимельштейна, и городской. Одной из причин появления городской организации стало несогласие ее учредителей с действиями руководства областного отделения во главе с тогдашним председателем Ростиславом Филипповым. На протяжении нескольких месяцев тот являлся главным редактором газеты-двойника "Новое честное слово", созданной для дискредитации оппозиционного издания "Честное слово". Издание газеты-двойника противоречит журналистской этике. 

Тридцатого мая 2001 года городское отделение Союза журналистов России было зарегистрировано в Главном управлении Министерства юстиции РФ по Иркутской области. Иркутское городское отделение не входит в состав областного и напрямую взаимодействует с Союзом журналистов России. Среди целей, указанных в уставе организации - утверждение и реализация свободы массовой информации, содействие профессиональной и творческой деятельности журналистов, их экономических и профессионально-творческих интересов, авторских прав, чести и достоинства.

Конкуренции между этими союзами, в отличие от союзов писателей, которых в Иркутске тоже два, не произошло – у них вообще не оказалось никаких точек пересечения. Собственно, областной Союз журналистов, который являлся наследником “советского” Союза журналистов, существовал лишь номинально, однако исправно получал хоть небольшое, но финансирование из бюджета. В городском же Союзе сконцентрировались наиболее активные и зачастую оппозиционные журналисты. Ведь именно городской Союз журналистов провел в конце 2004 года нашумевший конкурс “Профи” – первый независимый конкурс такого рода в регионе.

В конце сентября 2005 года в области появилась байкальская школа журналисткого мастерства.  Создатели школы - Иркутское городское отделение Союза журналистов России, областная Ассоциация начинающих журналистов и Восточно-Сибирская железная дорога.

Между тем в журналистской среде накопилось достаточно проблем, которые следовало бы решать именно на уровне областного Союза журналистов – если рассматривать союз журналистов не как формальную организацию, а как некий профсоюз, способный отстаивать свои интересы. В числе этих проблем – глобальные, в частности формирование взаимоотношений журналистов и властей, и локальные – такие, как получение бюджетных сумм на размещение официальной информации в СМИ.